37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1946 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  969    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1941  hypothetical protein  66.12 
 
 		 940 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1942  hypothetical protein  63.21 
 
 		 3225 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8090  hypothetical protein  55.17 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  32.17 
 
 		 9529 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1945  hypothetical protein  60 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  47.25 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  43.33 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2907  hypothetical protein  33.01 
 
 		 625 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.74 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  28.87 
 
 		 954 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 719 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3112  hypothetical protein  47.44 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.03 
 
 		 620 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  31.01 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  36.2 
 
 		 848 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  49 
 
 		 2272 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  47.46 
 
 		 273 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  42.57 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  38.03 
 
 		 346 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  46.53 
 
 		 928 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 2414 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  32 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.27 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1168 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49964  predicted protein  30 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.05 
 
 		 2179 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2411  hypothetical protein  31.09 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0411768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  44.23 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7327  hypothetical protein  38.36 
 
 		 539 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  29.69 
 
 		 855 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1375  hypothetical protein  51.16 
 
 		 165 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3108  hypothetical protein  42.11 
 
 		 594 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  44.68 
 
 		 985 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>