31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1337 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  816    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  41.76 
 
 
282 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  42.12 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  38.07 
 
 
272 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  38.31 
 
 
268 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.89 
 
 
1426 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  35.26 
 
 
783 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  28.57 
 
 
956 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.78 
 
 
1107 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  31.93 
 
 
604 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  31.72 
 
 
772 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  33.57 
 
 
709 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  36.26 
 
 
787 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  33.04 
 
 
554 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  34.4 
 
 
573 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  30.36 
 
 
773 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  32.26 
 
 
480 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  31.01 
 
 
150 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  44.29 
 
 
757 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  45.16 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  27.17 
 
 
743 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  33.6 
 
 
269 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  31.29 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1421  hypothetical protein  36 
 
 
575 aa  46.2  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000284545  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  29.66 
 
 
720 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  29.66 
 
 
720 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
3427 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  25.77 
 
 
504 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 
1538 aa  43.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>