38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1851 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 551 aa  1101    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1770  hypothetical protein  48.41 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0145229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1938  hypothetical protein  42.08 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1679  hypothetical protein  39.25 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1254  hypothetical protein  33.63 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1291  hypothetical protein  32.12 
 
 		 415 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2067  hypothetical protein  40.72 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2992  hypothetical protein  34.96 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01637e-18 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  67.35 
 
 		 573 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  51.82 
 
 		 3166 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  53.75 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  42.28 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  33.49 
 
 		 975 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  52.94 
 
 		 1457 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  51.76 
 
 		 2472 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  50 
 
 		 3787 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  47.92 
 
 		 2532 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  37.93 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  47.31 
 
 		 1013 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  48.6 
 
 		 3295 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  50.59 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  38.93 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  50 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  34.88 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  39.73 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  39.73 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  34.15 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  34.38 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  26.52 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  31.58 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  43.02 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1904  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.74 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0557  hypothetical protein  76.74 
 
 		 805 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000326191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  27.16 
 
 		 961 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  36.14 
 
 		 580 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  36.36 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  47.06 
 
 		 265 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>