32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2157 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  67.77 
 
 		 272 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  46.32 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  45.37 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  37.63 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.71 
 
 		 1107 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  35.56 
 
 		 604 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  32.12 
 
 		 599 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  31.96 
 
 		 783 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  32.54 
 
 		 956 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.18 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  44 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 772 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  35.37 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  24.38 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  35.09 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  29.03 
 
 		 757 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  29.5 
 
 		 773 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  35.61 
 
 		 7919 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  35.61 
 
 		 7679 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  41.03 
 
 		 380 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  30.25 
 
 		 554 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 611 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  23.83 
 
 		 504 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  35.96 
 
 		 508 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.64 
 
 		 3427 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  27.6 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 724 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  26.95 
 
 		 773 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1538 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>