15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00818 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 1107 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  35.66 
 
 		 956 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 772 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 743 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  30.19 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  33.58 
 
 		 783 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  34.02 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  32.26 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  32.65 
 
 		 395 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  31.06 
 
 		 435 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  26.85 
 
 		 773 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 475 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  36.46 
 
 		 787 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>