18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1398 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  100 
 
 		 508 aa  1046    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  51.38 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  29.67 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  35.68 
 
 		 956 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  35.36 
 
 		 783 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  29.73 
 
 		 296 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  31.21 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25.14 
 
 		 1426 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  36.21 
 
 		 268 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  30.91 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  28.91 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  25.73 
 
 		 772 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  27.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  38.68 
 
 		 1107 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  36.07 
 
 		 787 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 589 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  27.61 
 
 		 599 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  30.36 
 
 		 395 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>