39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0410 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 772 aa  1586    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  43.55 
 
 		 743 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.95 
 
 		 1107 aa  89.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  42.06 
 
 		 282 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  38.06 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  29.1 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 956 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  29.19 
 
 		 268 aa  60.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.99 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  57.89 
 
 		 1362 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  28.75 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  50.77 
 
 		 852 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  35.14 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  27.67 
 
 		 599 aa  54.3  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 504 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  52.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 629 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30.17 
 
 		 611 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  28.02 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  47.89 
 
 		 2848 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  31.25 
 
 		 560 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 589 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 629 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 629 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 629 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  29.76 
 
 		 972 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  34.38 
 
 		 302 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 628 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32.28 
 
 		 1426 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.76 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  45.24 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.07 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  37.68 
 
 		 823 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  43.1 
 
 		 361 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  28.18 
 
 		 299 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  48.61 
 
 		 1480 aa  44.3  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  27.33 
 
 		 968 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  27.96 
 
 		 269 aa  44.3  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>