25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2335 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1111    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  38.87 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  36.32 
 
 		 783 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  29.87 
 
 		 956 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  37.3 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  32.33 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  33.96 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  34.9 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.31 
 
 		 1426 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  30.46 
 
 		 579 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  30.37 
 
 		 296 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  36.79 
 
 		 588 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  31.33 
 
 		 709 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  51.2  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  41.89 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29.45 
 
 		 1107 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0144  hypothetical protein  35.23 
 
 		 577 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  34.09 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  32.77 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  26.7 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  46.94 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  34.93 
 
 		 599 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  31.25 
 
 		 596 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  28.3 
 
 		 480 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>