15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0144 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  95.65 
 
 		 579 aa  1078    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  96.53 
 
 		 577 aa  1059    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1193    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0737  hypothetical protein  34.7 
 
 		 625 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  35.33 
 
 		 601 aa  337  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  31.69 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  31.62 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  43.53 
 
 		 783 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  36.78 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  30.2 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  34.88 
 
 		 956 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  42.55 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  34.18 
 
 		 772 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  28.1 
 
 		 313 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  30.93 
 
 		 757 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>