11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0737 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1282    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  45.65 
 
 		 601 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  35.36 
 
 		 579 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0144  hypothetical protein  34.38 
 
 		 577 aa  334  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  34.21 
 
 		 577 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  30.67 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  31.66 
 
 		 588 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  29.03 
 
 		 757 aa  47.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  40.43 
 
 		 545 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>