17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0106 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1177    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  79.05 
 
 		 589 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  34.11 
 
 		 783 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  32.28 
 
 		 956 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.32 
 
 		 1426 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 743 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  39.13 
 
 		 757 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 772 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  29.7 
 
 		 272 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  32.39 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  44 
 
 		 709 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  37.21 
 
 		 601 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  33.96 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 605 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  37.65 
 
 		 3146 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>