16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2724 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  61.07 
 
 		 604 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1216    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  26.7 
 
 		 956 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  28.94 
 
 		 783 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.29 
 
 		 1426 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  35.71 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  32.12 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  31.18 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.59 
 
 		 1107 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 772 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  31.3 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  23.66 
 
 		 743 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  27.75 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  24.59 
 
 		 709 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>