232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2640 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  57.05 
 
 		 715 aa  799    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  62.6 
 
 		 731 aa  893    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  62.74 
 
 		 731 aa  896    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  79.92 
 
 		 711 aa  1185    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.49 
 
 		 788 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  62.62 
 
 		 749 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.52 
 
 		 771 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  61.08 
 
 		 713 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  53.22 
 
 		 779 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.77 
 
 		 771 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  62.21 
 
 		 749 aa  907    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 		 719 aa  1482    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  54.94 
 
 		 727 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  62.12 
 
 		 713 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  62.74 
 
 		 731 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  73.11 
 
 		 714 aa  1030    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  57.09 
 
 		 745 aa  797    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  96.24 
 
 		 719 aa  1403    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  53.68 
 
 		 692 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.37 
 
 		 775 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.27 
 
 		 704 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  53.1 
 
 		 777 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  53.64 
 
 		 773 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  53.4 
 
 		 692 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  54.36 
 
 		 768 aa  763    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  53.1 
 
 		 777 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.4 
 
 		 734 aa  901    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  55.05 
 
 		 770 aa  779    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  63.67 
 
 		 735 aa  890    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  62.74 
 
 		 731 aa  896    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  62.74 
 
 		 731 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  62.74 
 
 		 731 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  45.79 
 
 		 727 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.35 
 
 		 711 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  44.37 
 
 		 702 aa  564  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.64 
 
 		 702 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  47.14 
 
 		 782 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  45.36 
 
 		 717 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.38 
 
 		 903 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.06 
 
 		 714 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  45.69 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  43.93 
 
 		 704 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  45.69 
 
 		 700 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  45.69 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  45.04 
 
 		 865 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  44.93 
 
 		 714 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  45.69 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  45.69 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.28 
 
 		 717 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  45.11 
 
 		 706 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.31 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  44.65 
 
 		 749 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  44.07 
 
 		 704 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.07 
 
 		 704 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.11 
 
 		 705 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  44.65 
 
 		 714 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  44.07 
 
 		 704 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.46 
 
 		 704 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  45.33 
 
 		 703 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  43.87 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.72 
 
 		 706 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  44.52 
 
 		 749 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.17 
 
 		 752 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.86 
 
 		 703 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.36 
 
 		 723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.84 
 
 		 742 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.84 
 
 		 729 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  43.83 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.9 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  43.03 
 
 		 724 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.83 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.83 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  43.23 
 
 		 723 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.2 
 
 		 723 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.83 
 
 		 700 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  43.06 
 
 		 723 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  43.06 
 
 		 723 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.69 
 
 		 700 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  43.77 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.6 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.37 
 
 		 805 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.94 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.45 
 
 		 686 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  41.7 
 
 		 709 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.39 
 
 		 687 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  38.85 
 
 		 730 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  38.82 
 
 		 730 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  39.31 
 
 		 717 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  38.56 
 
 		 816 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.22 
 
 		 708 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  45.5 
 
 		 655 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1179  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.7 
 
 		 812 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  40.16 
 
 		 542 aa  307  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  36.31 
 
 		 591 aa  302  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  39.52 
 
 		 485 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  36.33 
 
 		 520 aa  264  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  35.11 
 
 		 514 aa  259  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  35.31 
 
 		 521 aa  257  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.27 
 
 		 835 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  34.69 
 
 		 516 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>