229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0881 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  59.17 
 
 
731 aa  904    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  74.21 
 
 
768 aa  1193    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  59.29 
 
 
731 aa  906    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  53.5 
 
 
711 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  59.29 
 
 
749 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  50.32 
 
 
713 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  74.49 
 
 
779 aa  1191    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  46.58 
 
 
715 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  58.41 
 
 
749 aa  920    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.62 
 
 
734 aa  889    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  50.32 
 
 
713 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  49.94 
 
 
714 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  54.07 
 
 
745 aa  807    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 
788 aa  1634    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  73.1 
 
 
771 aa  1152    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  75.13 
 
 
771 aa  1204    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.49 
 
 
719 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  74.87 
 
 
777 aa  1201    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  74.24 
 
 
773 aa  1201    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  74.87 
 
 
777 aa  1201    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  70.09 
 
 
770 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  55.02 
 
 
735 aa  791    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  74.37 
 
 
775 aa  1187    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  59.29 
 
 
731 aa  906    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  59.29 
 
 
731 aa  906    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.76 
 
 
719 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  59.29 
 
 
731 aa  906    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  59.17 
 
 
731 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.59 
 
 
692 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.47 
 
 
692 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  44.06 
 
 
727 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.01 
 
 
782 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  43.42 
 
 
727 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.38 
 
 
704 aa  558  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.62 
 
 
711 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.49 
 
 
729 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  41.39 
 
 
702 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  38.91 
 
 
703 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  39.53 
 
 
717 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  38.61 
 
 
706 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.45 
 
 
706 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.37 
 
 
703 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.1 
 
 
717 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  39.17 
 
 
706 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.45 
 
 
704 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.48 
 
 
714 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  38.61 
 
 
749 aa  479  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  38.61 
 
 
714 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  38.61 
 
 
714 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.76 
 
 
705 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.61 
 
 
714 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.73 
 
 
702 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  39.05 
 
 
903 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  39.1 
 
 
700 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  39.1 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  39.1 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  39.1 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.59 
 
 
700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.46 
 
 
700 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  39.1 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  39.24 
 
 
742 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  38.85 
 
 
865 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.36 
 
 
752 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  38.48 
 
 
705 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  38.48 
 
 
705 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  38.48 
 
 
749 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  38.56 
 
 
705 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  37.98 
 
 
700 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  37.7 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.83 
 
 
704 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  37.83 
 
 
704 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  37.83 
 
 
704 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.39 
 
 
689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.7 
 
 
723 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.25 
 
 
723 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  37.58 
 
 
723 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  36.88 
 
 
723 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  37.58 
 
 
723 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  35.97 
 
 
724 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  37.32 
 
 
709 aa  429  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  37.04 
 
 
717 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.01 
 
 
686 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.07 
 
 
707 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  35.1 
 
 
730 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  34.74 
 
 
730 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.23 
 
 
805 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.6 
 
 
686 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.2 
 
 
708 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  34.28 
 
 
816 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  40.78 
 
 
655 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.36 
 
 
687 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5383  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.34 
 
 
835 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.16 
 
 
838 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.14 
 
 
835 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1179  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.97 
 
 
812 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0724  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.96 
 
 
828 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.052451  normal  0.208625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  35.85 
 
 
591 aa  289  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  35.93 
 
 
485 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.71 
 
 
844 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3844  Phospholipase C  33.45 
 
 
522 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0676329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>