228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1163 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  57.42 
 
 
729 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  100 
 
 
782 aa  1611    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  56.76 
 
 
702 aa  746    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  63.21 
 
 
727 aa  783    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.66 
 
 
768 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  62.67 
 
 
711 aa  793    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.38 
 
 
775 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  44.97 
 
 
777 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  44.97 
 
 
777 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.18 
 
 
771 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  43.94 
 
 
773 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.37 
 
 
788 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  47.19 
 
 
734 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.64 
 
 
771 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  45.81 
 
 
779 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  43.58 
 
 
735 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  48.25 
 
 
692 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  47.95 
 
 
692 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  46.22 
 
 
711 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.51 
 
 
719 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  47.03 
 
 
713 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  45.43 
 
 
731 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.8 
 
 
719 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  45.43 
 
 
731 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  45.49 
 
 
749 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  46.58 
 
 
713 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  44.85 
 
 
749 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  45.28 
 
 
731 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.43 
 
 
731 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  45.43 
 
 
731 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  45.28 
 
 
731 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  46.51 
 
 
745 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  42.02 
 
 
727 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  45.41 
 
 
715 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  43.92 
 
 
770 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.95 
 
 
704 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  43.5 
 
 
714 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.88 
 
 
717 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.01 
 
 
705 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.22 
 
 
714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.45 
 
 
706 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  42.9 
 
 
717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  43.45 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.84 
 
 
752 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  43.88 
 
 
700 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  43.88 
 
 
700 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.04 
 
 
903 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.88 
 
 
700 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  43.27 
 
 
865 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.09 
 
 
702 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  39.98 
 
 
714 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  43.88 
 
 
700 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.88 
 
 
700 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  43.51 
 
 
706 aa  466  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  42.26 
 
 
749 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  42.26 
 
 
714 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.98 
 
 
714 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  43.66 
 
 
742 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.08 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.68 
 
 
700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.53 
 
 
700 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  42 
 
 
703 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.88 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  43.19 
 
 
749 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  38.88 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  38.88 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.32 
 
 
703 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  41.97 
 
 
704 aa  446  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  42.62 
 
 
700 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.92 
 
 
705 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.92 
 
 
705 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.77 
 
 
705 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.1 
 
 
707 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.59 
 
 
689 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.73 
 
 
686 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  35.86 
 
 
717 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.78 
 
 
686 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  39.17 
 
 
709 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  39.56 
 
 
816 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  38.58 
 
 
723 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.56 
 
 
723 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  38.92 
 
 
724 aa  386  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  35.7 
 
 
730 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  35.53 
 
 
730 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.3 
 
 
723 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  39.22 
 
 
723 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  39.22 
 
 
723 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  40.38 
 
 
655 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.85 
 
 
805 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.34 
 
 
687 aa  350  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.89 
 
 
708 aa  349  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  33.96 
 
 
591 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  35.47 
 
 
485 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  35.57 
 
 
542 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  34.99 
 
 
514 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  33.86 
 
 
520 aa  224  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  33.72 
 
 
516 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  33.12 
 
 
521 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3844  Phospholipase C  33.68 
 
 
522 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0676329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01545  phospholipase C  46.78 
 
 
308 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>