232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1048 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  49.59 
 
 
717 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.92 
 
 
700 aa  890    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  64.63 
 
 
700 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  82.57 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  82.71 
 
 
903 aa  1204    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  82.57 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  94.26 
 
 
749 aa  1365    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  51.04 
 
 
706 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  64.39 
 
 
703 aa  915    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  82.71 
 
 
700 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  83 
 
 
865 aa  1198    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  56.88 
 
 
707 aa  810    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  64.72 
 
 
703 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  82.57 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  49.86 
 
 
717 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.92 
 
 
700 aa  894    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  57.86 
 
 
686 aa  792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  97.76 
 
 
714 aa  1422    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  97.9 
 
 
749 aa  1423    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  98.6 
 
 
714 aa  1451    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 
714 aa  1468    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  54.91 
 
 
709 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  97.9 
 
 
714 aa  1424    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  82.57 
 
 
700 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  65.53 
 
 
704 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  92.44 
 
 
752 aa  1352    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  51.46 
 
 
705 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.76 
 
 
705 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  50.49 
 
 
706 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  51.32 
 
 
705 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.63 
 
 
706 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  51.32 
 
 
705 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  51.04 
 
 
742 aa  622  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.81 
 
 
692 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.39 
 
 
692 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.85 
 
 
723 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  46.71 
 
 
723 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  46.71 
 
 
723 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.83 
 
 
704 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  46.83 
 
 
704 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.44 
 
 
723 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  46.83 
 
 
704 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  46.31 
 
 
723 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  46.83 
 
 
704 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  46.18 
 
 
724 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  45.34 
 
 
713 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.9 
 
 
689 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  46.5 
 
 
713 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  46.22 
 
 
816 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  44.08 
 
 
727 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.05 
 
 
719 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.08 
 
 
734 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  44.37 
 
 
749 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.2 
 
 
719 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  44.75 
 
 
731 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  44.61 
 
 
749 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  44.74 
 
 
711 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.61 
 
 
731 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  44.48 
 
 
731 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  44.38 
 
 
735 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.35 
 
 
805 aa  515  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  42.31 
 
 
717 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  43.01 
 
 
727 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  42.22 
 
 
745 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  41.02 
 
 
730 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.36 
 
 
768 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.24 
 
 
711 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  40.75 
 
 
730 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.08 
 
 
771 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  40.1 
 
 
773 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  39.57 
 
 
779 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  42.03 
 
 
714 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.61 
 
 
788 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.52 
 
 
775 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.29 
 
 
687 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  40.32 
 
 
715 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  39.3 
 
 
777 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  39.3 
 
 
777 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.7 
 
 
729 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  40.44 
 
 
770 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  40.22 
 
 
782 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.24 
 
 
704 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.57 
 
 
771 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  40.35 
 
 
702 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.28 
 
 
686 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.11 
 
 
708 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  46.09 
 
 
655 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.83 
 
 
702 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  37.68 
 
 
591 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  41.25 
 
 
485 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  39.65 
 
 
542 aa  297  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  40.39 
 
 
520 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  39.1 
 
 
521 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  38.01 
 
 
516 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  37.92 
 
 
514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3844  Phospholipase C  38.65 
 
 
522 aa  267  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0676329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.82 
 
 
844 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>