231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1068 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.46 
 
 		 771 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  55.53 
 
 		 715 aa  782    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  75.1 
 
 		 731 aa  1123    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  63.44 
 
 		 711 aa  881    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  75.1 
 
 		 749 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.06 
 
 		 768 aa  874    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  60.51 
 
 		 713 aa  855    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  58.25 
 
 		 779 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  74.97 
 
 		 731 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  74.97 
 
 		 749 aa  1136    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  74.97 
 
 		 731 aa  1121    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  53.32 
 
 		 727 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  59.16 
 
 		 713 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  59.13 
 
 		 771 aa  871    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.4 
 
 		 719 aa  895    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  59.78 
 
 		 714 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  65.29 
 
 		 745 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.57 
 
 		 775 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  58.7 
 
 		 777 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 		 734 aa  1519    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  59.23 
 
 		 773 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  51.23 
 
 		 692 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.62 
 
 		 788 aa  900    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  58.7 
 
 		 777 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  58.4 
 
 		 770 aa  843    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  68.29 
 
 		 735 aa  985    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  75.1 
 
 		 731 aa  1123    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  75.1 
 
 		 731 aa  1123    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  51.63 
 
 		 692 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  75.1 
 
 		 731 aa  1123    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.54 
 
 		 719 aa  890    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  45.58 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  48.73 
 
 		 704 aa  601  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  47.19 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.68 
 
 		 711 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  45.62 
 
 		 703 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.42 
 
 		 704 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.23 
 
 		 714 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.76 
 
 		 703 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  45.23 
 
 		 749 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  45.23 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  45.23 
 
 		 714 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.71 
 
 		 903 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.62 
 
 		 752 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.09 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  44.71 
 
 		 700 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  44.71 
 
 		 700 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.59 
 
 		 700 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  44.71 
 
 		 700 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  44.71 
 
 		 700 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.34 
 
 		 702 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  44.71 
 
 		 700 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.8 
 
 		 700 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  44.8 
 
 		 700 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  44.62 
 
 		 865 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.14 
 
 		 723 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 702 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  44.77 
 
 		 717 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  45.09 
 
 		 749 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  43.14 
 
 		 723 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.48 
 
 		 717 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  42.69 
 
 		 724 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  42.22 
 
 		 723 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  42.22 
 
 		 723 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.75 
 
 		 729 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.09 
 
 		 723 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  44.34 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  43.45 
 
 		 706 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  42.68 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.4 
 
 		 742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.05 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.57 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.72 
 
 		 704 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  42.72 
 
 		 704 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  42.72 
 
 		 704 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.81 
 
 		 686 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  43.74 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.41 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.74 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.47 
 
 		 705 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.45 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  41.49 
 
 		 709 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  40.94 
 
 		 717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.17 
 
 		 805 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.01 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.82 
 
 		 687 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  37.85 
 
 		 730 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  37.72 
 
 		 730 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  37.45 
 
 		 816 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.4 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.26 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  42.76 
 
 		 655 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0454  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.41 
 
 		 844 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.546785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1179  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.78 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  36.02 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  37.9 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  36.65 
 
 		 520 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  35.85 
 
 		 542 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.06 
 
 		 844 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  34.48 
 
 		 521 aa  246  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>