232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0319 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  64.96 
 
 		 700 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  65.1 
 
 		 700 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  100 
 
 		 700 aa  1432    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  64.63 
 
 		 714 aa  900    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  64.63 
 
 		 714 aa  901    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  65.1 
 
 		 700 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  64.86 
 
 		 903 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  64.63 
 
 		 749 aa  882    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  55.65 
 
 		 709 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  65.38 
 
 		 865 aa  922    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  56.98 
 
 		 707 aa  810    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  64.81 
 
 		 700 aa  912    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  71.83 
 
 		 703 aa  1030    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  86.86 
 
 		 700 aa  1250    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.44 
 
 		 686 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  64.49 
 
 		 749 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  87.14 
 
 		 700 aa  1252    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  64.2 
 
 		 714 aa  895    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  64.49 
 
 		 714 aa  898    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  71.12 
 
 		 703 aa  1026    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  65.19 
 
 		 752 aa  908    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  72.48 
 
 		 704 aa  1038    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  65.1 
 
 		 700 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  50.56 
 
 		 706 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  50.69 
 
 		 706 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  49.79 
 
 		 717 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  50.48 
 
 		 717 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.28 
 
 		 705 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.42 
 
 		 706 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  50.69 
 
 		 742 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  50 
 
 		 705 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  50 
 
 		 705 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  50 
 
 		 705 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  47.79 
 
 		 704 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.6 
 
 		 692 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  47.51 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  47.51 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.46 
 
 		 692 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  47.51 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  46.21 
 
 		 816 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.96 
 
 		 689 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.8 
 
 		 734 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  45.43 
 
 		 713 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  44.22 
 
 		 749 aa  535  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  45.99 
 
 		 723 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.26 
 
 		 723 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  45.99 
 
 		 723 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  45.81 
 
 		 724 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  45.45 
 
 		 723 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.45 
 
 		 723 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  43.56 
 
 		 731 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  43.69 
 
 		 731 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  43.69 
 
 		 749 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  43.69 
 
 		 731 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  43.69 
 
 		 731 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  43.69 
 
 		 731 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  43.69 
 
 		 731 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  44.73 
 
 		 711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  45.64 
 
 		 713 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.13 
 
 		 805 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  44.16 
 
 		 735 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  42.82 
 
 		 717 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.96 
 
 		 719 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  42.01 
 
 		 715 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.77 
 
 		 719 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  41.74 
 
 		 745 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  41.03 
 
 		 727 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  42.72 
 
 		 714 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  40.85 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  43.15 
 
 		 727 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.45 
 
 		 775 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.08 
 
 		 771 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.95 
 
 		 687 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  40.18 
 
 		 779 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  39.85 
 
 		 773 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  41.22 
 
 		 730 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.82 
 
 		 768 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  41.38 
 
 		 730 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.98 
 
 		 788 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.77 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.08 
 
 		 771 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  40.18 
 
 		 770 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.11 
 
 		 704 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.47 
 
 		 729 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.62 
 
 		 782 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.65 
 
 		 708 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  39.7 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  43.11 
 
 		 655 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.64 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.81 
 
 		 702 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  42.54 
 
 		 485 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  37.95 
 
 		 591 aa  330  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  41.54 
 
 		 542 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  39.67 
 
 		 521 aa  282  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  38.49 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.37 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.23 
 
 		 838 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  39.33 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  36.83 
 
 		 516 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>