230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3198 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  98.75 
 
 
723 aa  1480    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  95.84 
 
 
724 aa  1403    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  95.71 
 
 
723 aa  1405    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  100 
 
 
723 aa  1496    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  95.71 
 
 
723 aa  1405    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  95.3 
 
 
723 aa  1397    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  47.32 
 
 
749 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  47.52 
 
 
714 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  47.32 
 
 
714 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  47.58 
 
 
700 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  47.58 
 
 
700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  47.45 
 
 
700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  47.45 
 
 
903 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  47.45 
 
 
865 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  47.58 
 
 
700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  47.58 
 
 
700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.31 
 
 
714 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.85 
 
 
752 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  46.58 
 
 
714 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  46.98 
 
 
749 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  48.05 
 
 
705 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  48.05 
 
 
705 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  48.05 
 
 
705 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.3 
 
 
705 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  48.04 
 
 
742 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  46.22 
 
 
706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  46.36 
 
 
713 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.2 
 
 
706 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  46.36 
 
 
706 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  46.19 
 
 
717 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.32 
 
 
692 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  45.18 
 
 
692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.79 
 
 
717 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  45.09 
 
 
704 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  45.09 
 
 
704 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.38 
 
 
703 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.09 
 
 
704 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  44.95 
 
 
704 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  45.65 
 
 
703 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.39 
 
 
704 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  45.29 
 
 
713 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.14 
 
 
734 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.34 
 
 
689 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  45.45 
 
 
700 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.83 
 
 
700 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.5 
 
 
700 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.98 
 
 
707 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.74 
 
 
719 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  41.83 
 
 
709 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.36 
 
 
719 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  42.13 
 
 
749 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  42.52 
 
 
749 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  42.13 
 
 
731 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  41.99 
 
 
731 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  41.99 
 
 
731 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  43.79 
 
 
727 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.13 
 
 
731 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  42.13 
 
 
731 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  42.13 
 
 
731 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  42.3 
 
 
735 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  43.8 
 
 
711 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  40.77 
 
 
727 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  41.37 
 
 
730 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  41.67 
 
 
730 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.11 
 
 
686 aa  489  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  42.28 
 
 
717 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  41.42 
 
 
745 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.58 
 
 
708 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  40.68 
 
 
714 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.27 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  39.36 
 
 
770 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  38.05 
 
 
773 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.14 
 
 
771 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  39.27 
 
 
816 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.22 
 
 
775 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  37 
 
 
788 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.33 
 
 
686 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  37.97 
 
 
777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  38.52 
 
 
715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  37.97 
 
 
777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  37.42 
 
 
779 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.78 
 
 
771 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.42 
 
 
768 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  39.28 
 
 
702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.57 
 
 
704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.56 
 
 
687 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.41 
 
 
711 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.62 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  44.46 
 
 
655 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.71 
 
 
702 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  38.58 
 
 
782 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  41.07 
 
 
485 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  38.19 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  35.97 
 
 
591 aa  307  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  38.32 
 
 
514 aa  303  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  36.27 
 
 
520 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  37.04 
 
 
521 aa  280  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  36.17 
 
 
516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1225  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.38 
 
 
848 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0247012  hitchhiker  0.00268403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.92 
 
 
838 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>