216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1336 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5383  phospholipase C, phosphocholine-specific  54.43 
 
 
835 aa  944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  53.81 
 
 
835 aa  945    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0724  phospholipase C, phosphocholine-specific  47.22 
 
 
828 aa  735    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.052451  normal  0.208625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 
844 aa  1764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1179  phospholipase C, phosphocholine-specific  51.53 
 
 
812 aa  890    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223051  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0454  phospholipase C, phosphocholine-specific  56.2 
 
 
844 aa  976    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.546785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1225  phospholipase C, phosphocholine-specific  58.9 
 
 
848 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0247012  hitchhiker  0.00268403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  60.02 
 
 
838 aa  1045    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.18 
 
 
703 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  38.03 
 
 
706 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  37.07 
 
 
704 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  38.17 
 
 
692 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  36.52 
 
 
703 aa  274  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.42 
 
 
704 aa  272  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  37.37 
 
 
700 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  38.17 
 
 
692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.66 
 
 
706 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  37.39 
 
 
706 aa  270  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  36.96 
 
 
704 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.96 
 
 
704 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  36.96 
 
 
704 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  31.67 
 
 
591 aa  270  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.4 
 
 
705 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  37.21 
 
 
700 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  35.46 
 
 
717 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  35.81 
 
 
773 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  37 
 
 
903 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  37 
 
 
700 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  35.27 
 
 
709 aa  263  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  36.42 
 
 
865 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.06 
 
 
734 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  36.86 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  36.86 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  36.86 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  35.35 
 
 
770 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.93 
 
 
771 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.82 
 
 
714 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  35.88 
 
 
714 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.55 
 
 
700 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  36.34 
 
 
742 aa  257  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.94 
 
 
714 aa  257  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  35.94 
 
 
749 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  35.94 
 
 
714 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.94 
 
 
717 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  36.14 
 
 
705 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  36.14 
 
 
705 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.55 
 
 
686 aa  254  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.99 
 
 
700 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  36.14 
 
 
705 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  36.38 
 
 
749 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  36.38 
 
 
731 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.39 
 
 
768 aa  253  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.15 
 
 
707 aa  251  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.61 
 
 
752 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.38 
 
 
775 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  36.33 
 
 
749 aa  250  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  35.23 
 
 
777 aa  250  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  35.23 
 
 
777 aa  250  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  34.61 
 
 
779 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  35.5 
 
 
717 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  37.01 
 
 
735 aa  247  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  35.59 
 
 
749 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.71 
 
 
788 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.07 
 
 
689 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.58 
 
 
719 aa  240  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  35.48 
 
 
713 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  36.29 
 
 
745 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  38.28 
 
 
724 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.46 
 
 
771 aa  237  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  35.17 
 
 
816 aa  235  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.66 
 
 
723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  37.03 
 
 
723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  34.6 
 
 
713 aa  234  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  35.16 
 
 
711 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.08 
 
 
719 aa  233  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  34.54 
 
 
715 aa  233  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
723 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.08 
 
 
723 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  37.5 
 
 
723 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  34.39 
 
 
730 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 
727 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  34.39 
 
 
730 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 
727 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 
702 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.76 
 
 
708 aa  217  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  34.38 
 
 
714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.16 
 
 
729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.11 
 
 
711 aa  214  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.75 
 
 
702 aa  213  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.84 
 
 
704 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.4 
 
 
686 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.05 
 
 
805 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.12 
 
 
687 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  36.94 
 
 
655 aa  171  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  33.76 
 
 
782 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>