230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1179 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  47.21 
 
 
835 aa  815    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.42 
 
 
838 aa  860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  51.53 
 
 
844 aa  890    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0454  phospholipase C, phosphocholine-specific  48.82 
 
 
844 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.546785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1225  phospholipase C, phosphocholine-specific  49.06 
 
 
848 aa  856    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0247012  hitchhiker  0.00268403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0724  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.17 
 
 
828 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.052451  normal  0.208625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5383  phospholipase C, phosphocholine-specific  48.39 
 
 
835 aa  821    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1179  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 
812 aa  1699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223051  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.33 
 
 
734 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  33.17 
 
 
749 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  33.17 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  33.29 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  33.17 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  33.17 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  33.17 
 
 
749 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  33.17 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  33.17 
 
 
731 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  32.44 
 
 
715 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 
711 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.77 
 
 
768 aa  344  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.31 
 
 
771 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  30.96 
 
 
773 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  30.99 
 
 
770 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.55 
 
 
775 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 
777 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  30.48 
 
 
777 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  30.72 
 
 
779 aa  337  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.97 
 
 
788 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.43 
 
 
771 aa  328  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  32.05 
 
 
735 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  31.21 
 
 
713 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.48 
 
 
719 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.68 
 
 
719 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  37.93 
 
 
709 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  32.78 
 
 
591 aa  270  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.65 
 
 
752 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  35.65 
 
 
865 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  35.21 
 
 
903 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  35.43 
 
 
700 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  35.43 
 
 
700 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  36.15 
 
 
700 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.36 
 
 
714 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  35.43 
 
 
700 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  36.04 
 
 
700 aa  258  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.54 
 
 
707 aa  257  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  35.79 
 
 
700 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  35.36 
 
 
714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 
749 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  35.14 
 
 
714 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.92 
 
 
714 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.62 
 
 
703 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  36.7 
 
 
717 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.36 
 
 
704 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  35.36 
 
 
749 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  35.67 
 
 
703 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.03 
 
 
717 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.86 
 
 
705 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  37.53 
 
 
692 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  37.09 
 
 
692 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  35.65 
 
 
706 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.53 
 
 
700 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.9 
 
 
700 aa  241  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  34.86 
 
 
706 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.48 
 
 
686 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  35.79 
 
 
705 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  34.92 
 
 
742 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  35.57 
 
 
705 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  35.57 
 
 
705 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.72 
 
 
706 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  34.44 
 
 
704 aa  231  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.15 
 
 
689 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 
704 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  34.67 
 
 
704 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.67 
 
 
704 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  33.77 
 
 
717 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  32.39 
 
 
713 aa  221  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 
727 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  33.94 
 
 
745 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  32.24 
 
 
714 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  31.33 
 
 
730 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.87 
 
 
723 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  31.76 
 
 
730 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  31.87 
 
 
723 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  31.66 
 
 
723 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  31.66 
 
 
723 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.45 
 
 
723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  31.13 
 
 
724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.43 
 
 
708 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  30.7 
 
 
816 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  33.12 
 
 
727 aa  194  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 
702 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.1 
 
 
687 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.75 
 
 
704 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.44 
 
 
805 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.7 
 
 
711 aa  181  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.82 
 
 
702 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  36.99 
 
 
655 aa  177  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.74 
 
 
686 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  32.22 
 
 
782 aa  170  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.78 
 
 
729 aa  168  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>