232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4624 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  54.07 
 
 
788 aa  828    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  56.95 
 
 
719 aa  803    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  64.6 
 
 
731 aa  966    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  57.09 
 
 
719 aa  802    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  54.6 
 
 
771 aa  786    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  57.97 
 
 
711 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  64.6 
 
 
749 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  55.88 
 
 
713 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  55.5 
 
 
779 aa  804    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  64.33 
 
 
749 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  64.6 
 
 
731 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  51.12 
 
 
727 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  56.2 
 
 
713 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  54.84 
 
 
768 aa  801    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  64.33 
 
 
731 aa  962    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  54.07 
 
 
714 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  100 
 
 
745 aa  1546    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  54.61 
 
 
715 aa  782    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  55.73 
 
 
777 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  56.01 
 
 
773 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  49.8 
 
 
692 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  65.29 
 
 
734 aa  981    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  64.33 
 
 
731 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  55.73 
 
 
777 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  55.87 
 
 
775 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  54.93 
 
 
770 aa  783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  60.59 
 
 
735 aa  877    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  49.93 
 
 
692 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  64.6 
 
 
731 aa  966    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  55.83 
 
 
771 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  64.6 
 
 
731 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  46.16 
 
 
727 aa  628  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.82 
 
 
704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  44.69 
 
 
702 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.59 
 
 
711 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  42.67 
 
 
704 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  42.67 
 
 
704 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.67 
 
 
704 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  42.67 
 
 
704 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.66 
 
 
782 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.16 
 
 
704 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.4 
 
 
729 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.36 
 
 
742 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.94 
 
 
717 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.05 
 
 
703 aa  522  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.75 
 
 
714 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.23 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.23 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.04 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.3 
 
 
705 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  41.48 
 
 
706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  42.13 
 
 
717 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  41.12 
 
 
706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  42.5 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  42.5 
 
 
903 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  42.5 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  42.67 
 
 
703 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.82 
 
 
714 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  42.75 
 
 
749 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  43.1 
 
 
714 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  42.75 
 
 
714 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.5 
 
 
700 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  42.5 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  42.5 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.29 
 
 
752 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  42.09 
 
 
865 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.49 
 
 
700 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.83 
 
 
706 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.27 
 
 
702 aa  511  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.49 
 
 
700 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.82 
 
 
689 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  41.74 
 
 
700 aa  492  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  41.7 
 
 
749 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  41.37 
 
 
723 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.29 
 
 
723 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.42 
 
 
723 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  40.9 
 
 
724 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  41.37 
 
 
723 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  41.37 
 
 
723 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.24 
 
 
686 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.81 
 
 
707 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  39 
 
 
686 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  39.72 
 
 
717 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  39.16 
 
 
709 aa  446  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  39.2 
 
 
816 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  38.53 
 
 
730 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.76 
 
 
687 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  38.52 
 
 
730 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.47 
 
 
805 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.51 
 
 
708 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  39.63 
 
 
655 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0454  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.75 
 
 
844 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.546785  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3449  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.03 
 
 
835 aa  333  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.047951  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  35.59 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  38.39 
 
 
485 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  34.55 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  35.54 
 
 
520 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  36 
 
 
844 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  34.04 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1378  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.02 
 
 
838 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>