232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1045 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.78 
 
 
700 aa  890    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  64.2 
 
 
700 aa  889    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  54.62 
 
 
709 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  82.71 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  49.73 
 
 
717 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  82.86 
 
 
903 aa  1204    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  97.48 
 
 
714 aa  1417    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  94.82 
 
 
749 aa  1368    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  82.86 
 
 
700 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  82.71 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  82.29 
 
 
865 aa  1189    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  64.58 
 
 
703 aa  916    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  65.11 
 
 
704 aa  920    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  82.71 
 
 
700 aa  1200    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  50 
 
 
717 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  57.86 
 
 
686 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  92.16 
 
 
752 aa  1348    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  97.62 
 
 
749 aa  1418    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  98.6 
 
 
714 aa  1451    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  100 
 
 
714 aa  1467    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  64.39 
 
 
703 aa  911    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  97.62 
 
 
714 aa  1419    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  56.88 
 
 
707 aa  810    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  63.78 
 
 
700 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  82.71 
 
 
700 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  51.18 
 
 
706 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.9 
 
 
706 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  50.9 
 
 
706 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  51.18 
 
 
705 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  50.76 
 
 
705 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  51.18 
 
 
705 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  51.32 
 
 
705 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  50.9 
 
 
742 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.81 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  46.25 
 
 
692 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.71 
 
 
723 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.97 
 
 
704 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.85 
 
 
723 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  46.71 
 
 
723 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  46.97 
 
 
704 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3198  phospholipase C  46.58 
 
 
723 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  46.71 
 
 
723 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  46.97 
 
 
704 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  46.83 
 
 
704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6500  phospholipase C  46.18 
 
 
724 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.201273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  45.77 
 
 
713 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.62 
 
 
689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0663  phospholipase C  47.04 
 
 
713 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3735  twin-arginine translocation pathway signal  44.47 
 
 
727 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  46.36 
 
 
816 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.22 
 
 
734 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.05 
 
 
719 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  44.77 
 
 
749 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  45.06 
 
 
719 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  44.75 
 
 
731 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  44.61 
 
 
749 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  44.61 
 
 
731 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  44.61 
 
 
731 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  44.88 
 
 
711 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  44.48 
 
 
731 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  44.87 
 
 
735 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  42.92 
 
 
805 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  42.17 
 
 
717 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  42.57 
 
 
745 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3736  twin-arginine translocation pathway signal  43.01 
 
 
727 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.915212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3617  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.51 
 
 
711 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.36 
 
 
768 aa  498  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4676  hemolytic phospholipase C precursor  40.51 
 
 
730 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.08 
 
 
771 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  40.1 
 
 
773 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53360  hemolytic phospholipase C precursor  40.24 
 
 
730 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  42.03 
 
 
714 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  38.73 
 
 
788 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  40.58 
 
 
715 aa  485  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  39.45 
 
 
779 aa  482  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.88 
 
 
687 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  39.17 
 
 
777 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.4 
 
 
775 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  39.17 
 
 
777 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2716  phospholipase C, phosphocholine-specific  37.57 
 
 
729 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1163  non-hemolytic phospholipase C precursor  39.98 
 
 
782 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  40.31 
 
 
770 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.37 
 
 
704 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  40.61 
 
 
702 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.42 
 
 
686 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  39.44 
 
 
771 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  40.24 
 
 
708 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  46.09 
 
 
655 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  41.69 
 
 
702 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2452  Phospholipase C  37.15 
 
 
591 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  41.05 
 
 
485 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  41.13 
 
 
542 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  40.62 
 
 
520 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  38.79 
 
 
521 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  37.64 
 
 
516 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  37.92 
 
 
514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3844  Phospholipase C  38.43 
 
 
522 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0676329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1336  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.88 
 
 
844 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>