250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1839 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  96.97 
 
 
330 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  97.27 
 
 
330 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  90.3 
 
 
329 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  90.3 
 
 
329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  89.39 
 
 
329 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  89.39 
 
 
329 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  89.39 
 
 
329 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  89.18 
 
 
329 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  88.85 
 
 
329 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  82.32 
 
 
339 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  81.88 
 
 
337 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  76.76 
 
 
339 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  64.22 
 
 
330 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  60.12 
 
 
328 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  62.13 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  62.5 
 
 
331 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  62.16 
 
 
331 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  59.46 
 
 
299 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.11 
 
 
345 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  49.04 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  51.52 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  47.32 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  50.5 
 
 
313 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.95 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  48.97 
 
 
324 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  48.29 
 
 
324 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.27 
 
 
345 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.89 
 
 
410 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.48 
 
 
333 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  40.2 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.55 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.23 
 
 
384 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  31.51 
 
 
445 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  30.56 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.09 
 
 
366 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.13 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  27.17 
 
 
426 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.88 
 
 
348 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.96 
 
 
348 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.94 
 
 
347 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  27.95 
 
 
433 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  27.38 
 
 
456 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.96 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.14 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.82 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.62 
 
 
971 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.58 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.26 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.17 
 
 
556 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  33.13 
 
 
497 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.16 
 
 
362 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.28 
 
 
517 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.63 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.32 
 
 
1667 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.09 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  26.32 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 
689 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
776 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.54 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.36 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.49 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.38 
 
 
417 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.75 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.21 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.83 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.65 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.25 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.72 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.62 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.66 
 
 
752 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.6 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.18 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.57 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.48 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  26.23 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26 
 
 
1094 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.35 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.24 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.31 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.24 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.12 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.78 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.96 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>