13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3031 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3031  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  757    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1667 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2972  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  22.35 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0859  hypothetical protein  32.41 
 
 		 945 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0876  hypothetical protein  32.41 
 
 		 945 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.61 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0865  hypothetical protein  32.41 
 
 		 945 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1706  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  21.33 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3459  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.876631  normal  0.354488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2310  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.2 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>