18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2310 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3459  hypothetical protein  99.73 
 
 		 379 aa  774    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.876631  normal  0.354488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2310  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2942  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  90.35 
 
 		 373 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.818526  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2478  hypothetical protein  95.71 
 
 		 373 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0764  quinohemoprotein amine dehydrogease,beta subunit  59.48 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2979  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  37.35 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2972  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  29.95 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1706  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  32 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.72 
 
 		 810 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.25 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  24.57 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 776 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.1 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3031  hypothetical protein  27.22 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.28 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.56 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  28.14 
 
 		 556 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>