17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2942 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3459  hypothetical protein  90.35 
 
 		 379 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.876631  normal  0.354488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2310  hypothetical protein  90.35 
 
 		 373 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2478  hypothetical protein  90.35 
 
 		 373 aa  710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2942  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  100 
 
 		 373 aa  775    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.818526  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0764  quinohemoprotein amine dehydrogease,beta subunit  57.43 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2979  quinohemoprotein amine dehydrogenase 40 kDa subunit  38.53 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1706  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  32.09 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2972  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  28.99 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.06 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 776 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  30.39 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.07 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.1 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.74 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  27.2 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.93 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  29 
 
 		 556 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>