21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4739 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1568    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  25.96 
 
 
884 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.75 
 
 
393 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  28.39 
 
 
726 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.32 
 
 
396 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.9 
 
 
580 aa  94.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.45 
 
 
531 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  28.22 
 
 
566 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.35 
 
 
585 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  36.02 
 
 
898 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2956  hypothetical protein  26.41 
 
 
411 aa  72  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  43.75 
 
 
909 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2627  hypothetical protein  26.19 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  26.87 
 
 
396 aa  64.7  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.95 
 
 
581 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.82 
 
 
674 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.3 
 
 
578 aa  51.2  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  32.41 
 
 
500 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 
934 aa  45.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.81 
 
 
2816 aa  44.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>