14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2562 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1139    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11294  hypothetical protein  34.17 
 
 
232 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.19 
 
 
815 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  33.05 
 
 
927 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  29.33 
 
 
1058 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  39.02 
 
 
2305 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  43.66 
 
 
569 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  31.58 
 
 
601 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  28.08 
 
 
997 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2421  hypothetical protein  25.11 
 
 
285 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1656  hypothetical protein  27.98 
 
 
420 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.154352  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  25.98 
 
 
909 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  27.73 
 
 
906 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.86 
 
 
880 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.873421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>