30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5058 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  100 
 
 
927 aa  1798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  58.67 
 
 
3378 aa  964    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  45.25 
 
 
1046 aa  562  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  29.12 
 
 
2924 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.21 
 
 
9867 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.17 
 
 
11716 aa  89.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.5 
 
 
16311 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.73 
 
 
2555 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  36.42 
 
 
815 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.92 
 
 
6678 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
885 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  37 
 
 
997 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 
934 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  33.05 
 
 
565 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  35.71 
 
 
2305 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  34.78 
 
 
1058 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.65 
 
 
1428 aa  48.5  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  29.94 
 
 
1143 aa  48.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.64 
 
 
2816 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  36.73 
 
 
5218 aa  47.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.44 
 
 
5962 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.5 
 
 
2114 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 
2345 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 
3066 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  38.89 
 
 
5769 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  24.02 
 
 
912 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  38.57 
 
 
1867 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37 
 
 
2310 aa  45.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  44.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  29.93 
 
 
500 aa  44.3  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>