32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1698 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  100 
 
 
1046 aa  2021    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  42 
 
 
3378 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  45.25 
 
 
927 aa  562  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  30.45 
 
 
2924 aa  136  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.47 
 
 
9867 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  37.44 
 
 
2555 aa  99.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  30.42 
 
 
997 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.49 
 
 
11716 aa  78.2  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 
885 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  26.17 
 
 
912 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.84 
 
 
6678 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.54 
 
 
16311 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.84 
 
 
2305 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.07 
 
 
2310 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  49.37 
 
 
1428 aa  62.4  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.58 
 
 
2114 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.77 
 
 
815 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  34.33 
 
 
898 aa  57  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  34.25 
 
 
813 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 
5218 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  42.35 
 
 
1143 aa  52.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  30.25 
 
 
887 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  38.26 
 
 
5769 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.59 
 
 
5962 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.34 
 
 
2816 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  39.06 
 
 
601 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5061  hypothetical protein  61.11 
 
 
284 aa  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  52.5 
 
 
746 aa  47  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  43.55 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  35.71 
 
 
1434 aa  46.6  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  30 
 
 
854 aa  47.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.98 
 
 
3396 aa  45.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>