126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3600 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  72.58 
 
 		 563 aa  835    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1156    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  40.8 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  40.78 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  38.65 
 
 		 516 aa  339  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  37.3 
 
 		 519 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  40.78 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  26.13 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  28.33 
 
 		 391 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.7 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.21 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.83 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.28 
 
 		 651 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  42.59 
 
 		 1215 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  42.59 
 
 		 1215 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.97 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  21.89 
 
 		 817 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  25.86 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.48 
 
 		 846 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  23.36 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  23.37 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 1215 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  48.28 
 
 		 1022 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  23.42 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  23.7 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 1215 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 1215 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 781 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  24.15 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  22.6 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  23.02 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.18 
 
 		 1394 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  22.95 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  22.4 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  22.48 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  22.73 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  47.19 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  25.61 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  41.24 
 
 		 1367 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  22.73 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  31.63 
 
 		 892 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  38 
 
 		 994 aa  57.4  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  41 
 
 		 2848 aa  57  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  42.11 
 
 		 1911 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  24.32 
 
 		 676 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  22.82 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  23.94 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  24.31 
 
 		 708 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  43.75 
 
 		 3089 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  44.44 
 
 		 4848 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  41.24 
 
 		 721 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  41.05 
 
 		 1126 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 764 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  23.64 
 
 		 690 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  33.98 
 
 		 687 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  34.36 
 
 		 663 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.59 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  38 
 
 		 3816 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1727 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  22.91 
 
 		 679 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  22.55 
 
 		 664 aa  50.4  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  42.35 
 
 		 1027 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  38.05 
 
 		 2027 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  39.05 
 
 		 3191 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  24.13 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  39.18 
 
 		 2839 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  22.15 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  20.89 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  22.01 
 
 		 773 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.56 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  32.67 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  39.33 
 
 		 2039 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.56 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  32.69 
 
 		 676 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  22.52 
 
 		 678 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  35.05 
 
 		 2067 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36 
 
 		 1502 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  31.13 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.11 
 
 		 2816 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.58 
 
 		 1363 aa  47.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  20.88 
 
 		 828 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 353 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  25.56 
 
 		 436 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  38.04 
 
 		 3544 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  20.62 
 
 		 755 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.42 
 
 		 1712 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  39.51 
 
 		 2353 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1752 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  40.24 
 
 		 2567 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.21 
 
 		 994 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  44.16 
 
 		 2503 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.04 
 
 		 2476 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 802 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.87 
 
 		 3699 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  21.67 
 
 		 767 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>