100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3369 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1471    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  26.17 
 
 		 1367 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.68 
 
 		 1363 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2330  hypothetical protein  23.87 
 
 		 623 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.865327  normal  0.0759502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.6 
 
 		 1597 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.69 
 
 		 2114 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2271  hypothetical protein  23.37 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.846725  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.76 
 
 		 4978 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  34.69 
 
 		 721 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.12 
 
 		 3474 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1066 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1512 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.37 
 
 		 2816 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.17 
 
 		 5745 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  32.43 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.42 
 
 		 6211 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.88 
 
 		 892 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1416 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  39.69 
 
 		 4848 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  31.98 
 
 		 743 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  32.84 
 
 		 3477 aa  71.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.75 
 
 		 2807 aa  70.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  31.67 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.24 
 
 		 1269 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.25 
 
 		 850 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.26 
 
 		 761 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.59 
 
 		 1269 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.24 
 
 		 1268 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.78 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1744 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  32.09 
 
 		 1502 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.55 
 
 		 2839 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.21 
 
 		 3699 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.21 
 
 		 3699 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  31.46 
 
 		 663 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.03 
 
 		 2503 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  30.19 
 
 		 1911 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.19 
 
 		 3089 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1061 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.74 
 
 		 3363 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 		 3816 aa  61.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.78 
 
 		 2153 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.38 
 
 		 2476 aa  57.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.7 
 
 		 1884 aa  57.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  35.57 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.3 
 
 		 2522 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.93 
 
 		 2715 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  33.77 
 
 		 2084 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 846 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.05 
 
 		 1394 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.66 
 
 		 3544 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  40.96 
 
 		 4748 aa  54.7  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  31.32 
 
 		 743 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  29.44 
 
 		 2051 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  30.43 
 
 		 2011 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.06 
 
 		 1712 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.35 
 
 		 2039 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  28.17 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  41.57 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 		 982 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 		 1215 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.99 
 
 		 3927 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 		 1215 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  43.48 
 
 		 556 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  38.37 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  35.48 
 
 		 653 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  29.87 
 
 		 2040 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.59 
 
 		 2346 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  41.94 
 
 		 886 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.71 
 
 		 2377 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.71 
 
 		 1215 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 1410 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 1410 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1131 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  42.05 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 1408 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1006 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.38 
 
 		 3191 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1752 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2353 aa  47.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  32.2 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  28.12 
 
 		 2027 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  30 
 
 		 1781 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  42.86 
 
 		 5444 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  38.2 
 
 		 1131 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.2 
 
 		 1215 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  35.82 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 16322 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  39.34 
 
 		 653 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.9 
 
 		 8321 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  39.19 
 
 		 1027 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  27.51 
 
 		 2067 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  43.37 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 1422 aa  44.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  30.43 
 
 		 2052 aa  44.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  28.17 
 
 		 2670 aa  44.3  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.14 
 
 		 1867 aa  44.3  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  30.36 
 
 		 2145 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  45.1 
 
 		 891 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>