128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1773 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  50.89 
 
 		 1022 aa  902    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  100 
 
 		 1027 aa  2104    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  41.27 
 
 		 594 aa  329  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  37.76 
 
 		 560 aa  317  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  39.14 
 
 		 582 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  34.09 
 
 		 653 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  31.72 
 
 		 653 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  34.09 
 
 		 653 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.7 
 
 		 765 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  46.08 
 
 		 721 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  32.23 
 
 		 646 aa  89  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  48 
 
 		 1597 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  38.57 
 
 		 1215 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  38.57 
 
 		 1215 aa  79  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.63 
 
 		 2346 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  47.13 
 
 		 892 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.73 
 
 		 1394 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  48.28 
 
 		 1502 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.6 
 
 		 1712 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 1215 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  43.24 
 
 		 3474 aa  72  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  26.21 
 
 		 801 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  40.59 
 
 		 1215 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  43.69 
 
 		 1911 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  43.96 
 
 		 4848 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.59 
 
 		 1215 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1109  hypothetical protein  27.86 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  24.07 
 
 		 1178 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  43.69 
 
 		 3089 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.9 
 
 		 761 aa  69.3  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.21 
 
 		 2816 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  36.22 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  42.06 
 
 		 1367 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  44 
 
 		 814 aa  68.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  42 
 
 		 994 aa  68.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  41 
 
 		 850 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.17 
 
 		 1066 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.01 
 
 		 2114 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1538 aa  66.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.02 
 
 		 4978 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  37.5 
 
 		 1269 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  44.55 
 
 		 1781 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  42.22 
 
 		 2476 aa  65.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  41.9 
 
 		 1752 aa  64.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.89 
 
 		 3191 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  35.58 
 
 		 1268 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  24.86 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1126 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.39 
 
 		 3477 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  40.79 
 
 		 1363 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  41.11 
 
 		 2522 aa  62  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.64 
 
 		 8321 aa  62  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 4220 aa  62  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  41.11 
 
 		 3699 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.11 
 
 		 3699 aa  61.6  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1006 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 3363 aa  61.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  40 
 
 		 2503 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 16322 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.11 
 
 		 2377 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  39.33 
 
 		 2839 aa  60.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.67 
 
 		 1236 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  40 
 
 		 3544 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  34.01 
 
 		 886 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  27.14 
 
 		 1024 aa  59.7  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  35.64 
 
 		 1269 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  41.3 
 
 		 891 aa  58.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 		 1287 aa  58.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.67 
 
 		 846 aa  57.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.09 
 
 		 2153 aa  57.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.41 
 
 		 5745 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.37 
 
 		 1109 aa  56.6  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  40.45 
 
 		 556 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  34.95 
 
 		 2267 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  37 
 
 		 3816 aa  55.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.91 
 
 		 1884 aa  55.1  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  41.57 
 
 		 563 aa  55.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.08 
 
 		 4896 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  38.96 
 
 		 1867 aa  54.7  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1061 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  35.56 
 
 		 974 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 722 aa  53.5  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2478 aa  53.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  30.41 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  29.38 
 
 		 601 aa  52.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 		 4122 aa  52.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.33 
 
 		 1276 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  34.44 
 
 		 157 aa  52.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1744 aa  52  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  38.3 
 
 		 4748 aa  52  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  36.05 
 
 		 2602 aa  51.6  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1076 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  38.46 
 
 		 539 aa  51.6  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  42.19 
 
 		 5444 aa  51.6  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  24.73 
 
 		 388 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1518 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.91 
 
 		 2555 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3486 aa  50.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1512 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  38.36 
 
 		 2353 aa  50.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>