113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0529 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  100 
 
 		 653 aa  1334    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  98.16 
 
 		 653 aa  1310    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  91.42 
 
 		 653 aa  1190    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  35.25 
 
 		 1022 aa  217  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  29.25 
 
 		 560 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  34.09 
 
 		 1027 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  31.82 
 
 		 594 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  29.93 
 
 		 582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  45.71 
 
 		 1597 aa  84  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  37.1 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  49.5 
 
 		 1394 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  23.5 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 		 994 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  24.5 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  47 
 
 		 892 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.56 
 
 		 761 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.16 
 
 		 2114 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1781 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.7 
 
 		 850 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1752 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  30.74 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  24.44 
 
 		 1178 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.3 
 
 		 2816 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1512 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36.45 
 
 		 4978 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  30.05 
 
 		 1040 aa  64.3  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  42.86 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.38 
 
 		 1884 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  49.23 
 
 		 1416 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  51.43 
 
 		 1502 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  46.84 
 
 		 8321 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  41.76 
 
 		 1538 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  43.62 
 
 		 3486 aa  62.4  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  34.39 
 
 		 3474 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  40.91 
 
 		 3477 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.74 
 
 		 3363 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1109  hypothetical protein  23.65 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  38.21 
 
 		 1215 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  38.21 
 
 		 1215 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.46 
 
 		 1066 aa  60.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  24.28 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.78 
 
 		 2346 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.22 
 
 		 1236 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1006 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.6 
 
 		 5745 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  28.71 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.07 
 
 		 1215 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.41 
 
 		 3816 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  36.07 
 
 		 1215 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  40.86 
 
 		 1367 aa  58.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.05 
 
 		 1268 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  45.98 
 
 		 2476 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.36 
 
 		 4848 aa  57.4  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  43.59 
 
 		 1269 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  37.96 
 
 		 1215 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.28 
 
 		 3191 aa  57.4  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  32.82 
 
 		 974 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  45 
 
 		 1269 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  43.04 
 
 		 3544 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  38.78 
 
 		 1363 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.45 
 
 		 5769 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.44 
 
 		 3699 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 1712 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  43.48 
 
 		 4748 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.12 
 
 		 4220 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49604  predicted protein  25.35 
 
 		 608 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  34.23 
 
 		 1867 aa  55.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  38.3 
 
 		 891 aa  54.7  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  38.89 
 
 		 16322 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  44.71 
 
 		 3699 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  42.31 
 
 		 2522 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  43.68 
 
 		 2503 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.78 
 
 		 846 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  34.23 
 
 		 814 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  42.31 
 
 		 3927 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  39.78 
 
 		 2839 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  32.82 
 
 		 2848 aa  51.2  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  35.48 
 
 		 722 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  37.63 
 
 		 157 aa  50.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  31.79 
 
 		 2145 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  41.86 
 
 		 1911 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.24 
 
 		 2377 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 982 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  35 
 
 		 886 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 4122 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  37.97 
 
 		 3089 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  33.9 
 
 		 715 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  32.41 
 
 		 2767 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  36.14 
 
 		 1141 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  44.44 
 
 		 4854 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  35.14 
 
 		 2478 aa  48.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  37.78 
 
 		 4896 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  40.18 
 
 		 2698 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1744 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1518 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.79 
 
 		 1109 aa  47.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  40 
 
 		 1408 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  40 
 
 		 1410 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  40 
 
 		 1410 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>