31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0348 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  79.33 
 
 		 678 aa  1112    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  53.68 
 
 		 690 aa  776    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  55.22 
 
 		 645 aa  697    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  51.37 
 
 		 652 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  51.37 
 
 		 650 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  77.61 
 
 		 678 aa  1105    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  87.59 
 
 		 676 aa  1227    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  72.46 
 
 		 687 aa  1043    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  88.04 
 
 		 676 aa  1235    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  78.24 
 
 		 678 aa  1116    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  89.22 
 
 		 676 aa  1253    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  68.73 
 
 		 709 aa  1009    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  52.04 
 
 		 688 aa  732    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  52.27 
 
 		 664 aa  718    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  69.72 
 
 		 709 aa  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  69.72 
 
 		 709 aa  1008    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  100 
 
 		 679 aa  1433    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  55.9 
 
 		 656 aa  725    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  70.56 
 
 		 709 aa  1028    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  70.28 
 
 		 709 aa  1029    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  70.14 
 
 		 709 aa  1024    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  51.69 
 
 		 656 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.12 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.76 
 
 		 556 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  22.51 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  24.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.42 
 
 		 799 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.36 
 
 		 784 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.18 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 459 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>