50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2292 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  816    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  68.78 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  64.36 
 
 		 391 aa  544  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  30.45 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  24.67 
 
 		 640 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 781 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.43 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 771 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  26.46 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  23.53 
 
 		 755 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.41 
 
 		 758 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  29.18 
 
 		 595 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  22.57 
 
 		 778 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 654 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  24.57 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.13 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 828 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.7 
 
 		 556 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  23.47 
 
 		 651 aa  69.7  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  24.51 
 
 		 708 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  24.79 
 
 		 817 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  25.18 
 
 		 697 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  25.68 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.28 
 
 		 743 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 802 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.73 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.12 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.32 
 
 		 519 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  22.5 
 
 		 516 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  22.25 
 
 		 539 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  22.4 
 
 		 536 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  22.09 
 
 		 767 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  19.76 
 
 		 729 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  25.67 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  24.64 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  24.79 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  24.64 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  20.92 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  23.08 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  28.28 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  23.67 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  23.65 
 
 		 656 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  22.98 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  23.58 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>