36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6276 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  45.78 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  36.32 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 771 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  21.53 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.07 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  24.15 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.62 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.62 
 
 		 758 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.68 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.61 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 764 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  23.05 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  21.96 
 
 		 817 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  20.05 
 
 		 773 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.12 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  21.31 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 828 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.15 
 
 		 784 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.48 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  22.89 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.08 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  19.79 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  20.73 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 802 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  25 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 767 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.12 
 
 		 556 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  26.4 
 
 		 516 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  23.18 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 884 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>