34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2770 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1090    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  43.5 
 
 		 539 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  44.42 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  45.64 
 
 		 536 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  47.79 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  37.83 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  37.17 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  26.15 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  23.72 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.32 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.6 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.07 
 
 		 649 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  23.18 
 
 		 778 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  24.47 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 781 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  31.37 
 
 		 2670 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  21.69 
 
 		 742 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  24.34 
 
 		 817 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  24.34 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  22.7 
 
 		 353 aa  47  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.44 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.55 
 
 		 304 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  37.29 
 
 		 709 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1024  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA  29.32 
 
 		 605 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25.97 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.77 
 
 		 799 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  24.06 
 
 		 767 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  23.77 
 
 		 456 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.89 
 
 		 458 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.62 
 
 		 758 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 764 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  25 
 
 		 656 aa  43.5  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>