45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3639 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  100 
 
 
353 aa  732    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.59 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.4 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  22.42 
 
 
649 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  26.99 
 
 
563 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.48 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.71 
 
 
784 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  25.12 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.41 
 
 
743 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  26.67 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  28.39 
 
 
386 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  24.49 
 
 
651 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  24.52 
 
 
755 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  33.88 
 
 
1110 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  29.93 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  22.7 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  25.12 
 
 
556 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  35.8 
 
 
916 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  25.52 
 
 
539 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  25.31 
 
 
536 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.26 
 
 
758 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1334  cytochrome c family protein  30 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.141552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.97 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  25 
 
 
742 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.97 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  31.09 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.83 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  23.81 
 
 
540 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  22.44 
 
 
817 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  29.82 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  27.97 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.97 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  27.97 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.34 
 
 
429 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  28.07 
 
 
157 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  19.68 
 
 
799 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  23.58 
 
 
577 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
781 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3087  cytochrome c family protein  29.7 
 
 
153 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49258  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  29.31 
 
 
154 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>