34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1625 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  810    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  52.77 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 654 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.91 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  23.99 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.07 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  23.89 
 
 		 767 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  21 
 
 		 773 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.05 
 
 		 784 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 764 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  29.03 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 828 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.23 
 
 		 469 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  26.94 
 
 		 708 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  21.5 
 
 		 817 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 781 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  37.88 
 
 		 148 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  20.64 
 
 		 758 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.96 
 
 		 974 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  23.1 
 
 		 742 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 755 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  19.75 
 
 		 743 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  22.89 
 
 		 656 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  26.73 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  32.53 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 771 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 687 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  21.7 
 
 		 676 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>