22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2262 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  71.43 
 
 
156 aa  193  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  65.89 
 
 
153 aa  173  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  55.63 
 
 
155 aa  158  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  60.77 
 
 
192 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  55.64 
 
 
179 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  31.45 
 
 
561 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.97 
 
 
590 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  28 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  30.83 
 
 
240 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  32.23 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  36.76 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  32.26 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  30.65 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  38.37 
 
 
758 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  30.28 
 
 
916 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  37.74 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  52.78 
 
 
235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  52.78 
 
 
235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  52.78 
 
 
235 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  28.95 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.32 
 
 
974 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>