36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0479 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  100 
 
 		 709 aa  1495    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  49.72 
 
 		 690 aa  718    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  55.17 
 
 		 645 aa  723    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  50.79 
 
 		 652 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  50.79 
 
 		 650 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  66.57 
 
 		 678 aa  964    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  68.5 
 
 		 676 aa  990    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  84.58 
 
 		 687 aa  1234    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  68.17 
 
 		 676 aa  992    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  66.62 
 
 		 678 aa  964    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  68.59 
 
 		 676 aa  992    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  68.17 
 
 		 678 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  51.69 
 
 		 688 aa  701    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  94.91 
 
 		 709 aa  1398    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  50.95 
 
 		 656 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  93.35 
 
 		 709 aa  1384    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  88.12 
 
 		 709 aa  1307    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  93.07 
 
 		 709 aa  1382    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  93.78 
 
 		 709 aa  1389    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  51.92 
 
 		 664 aa  697    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  68.73 
 
 		 679 aa  1006    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  56.78 
 
 		 656 aa  753    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  22.69 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.7 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.61 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  21.52 
 
 		 536 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  23.48 
 
 		 469 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  27.57 
 
 		 286 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  22.57 
 
 		 394 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 537 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  21.82 
 
 		 755 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.95 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  19.86 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 287 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.77 
 
 		 425 aa  44.3  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  23.67 
 
 		 708 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>