12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000062 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000062  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.738723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2750  hypothetical protein  48.14 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000063  hypothetical protein  31.73 
 
 		 531 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1417  hypothetical protein  29.18 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0281732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1976  hypothetical protein  27.55 
 
 		 506 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.41004  normal  0.344943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.06 
 
 		 4896 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1441 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2434  hypothetical protein  26.8 
 
 		 566 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0527  hypothetical protein  26.97 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3504  hypothetical protein  26.4 
 
 		 573 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  30.87 
 
 		 2487 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0528  hypothetical protein  25.42 
 
 		 573 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>