22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1237 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  66.57 
 
 		 714 aa  980    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1469    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  67.46 
 
 		 713 aa  999    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  41.92 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  43.49 
 
 		 667 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  40.19 
 
 		 702 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  40.39 
 
 		 703 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  49.78 
 
 		 621 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  36.87 
 
 		 703 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  36.03 
 
 		 562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  32.13 
 
 		 561 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  29.52 
 
 		 549 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  45.24 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1003 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1898 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1147 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1441 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  25.58 
 
 		 757 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 808 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1946 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1669  hypothetical protein  24.26 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.435445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>