23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0249 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1258    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  49.78 
 
 		 719 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  48.7 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  48.51 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  40.26 
 
 		 702 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  41.42 
 
 		 702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  40.6 
 
 		 667 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  41.56 
 
 		 703 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1003 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1898 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  33.83 
 
 		 562 aa  97.8  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  38.86 
 
 		 703 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  30.38 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  27.92 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  40.2 
 
 		 153 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1147 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  38.29 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1230 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  26.35 
 
 		 757 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1946 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1669  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.435445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  28.23 
 
 		 3486 aa  44.3  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  30.59 
 
 		 1143 aa  43.5  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>