21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0313 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  57.91 
 
 
667 aa  761    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1435    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  53.81 
 
 
702 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  39.41 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  39.94 
 
 
714 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  40.39 
 
 
719 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  39.5 
 
 
713 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  38.36 
 
 
703 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  42 
 
 
621 aa  270  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  36.61 
 
 
562 aa  180  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  32.96 
 
 
549 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  29.43 
 
 
561 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  45.19 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  41.95 
 
 
669 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  37.06 
 
 
1898 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.38 
 
 
1003 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  24.16 
 
 
757 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  30 
 
 
1441 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  29.17 
 
 
1147 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06249  hypothetical protein  43.75 
 
 
48 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1669  hypothetical protein  26.94 
 
 
377 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.435445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>