16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3807 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  100 
 
 
549 aa  1142    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  30.22 
 
 
562 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  33.54 
 
 
561 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  33.33 
 
 
702 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  32.96 
 
 
703 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  34.19 
 
 
702 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  32.55 
 
 
667 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  30.99 
 
 
703 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  31.44 
 
 
714 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  29.52 
 
 
719 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  29.85 
 
 
713 aa  97.8  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  27.92 
 
 
621 aa  73.9  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1387  hypothetical protein  31.98 
 
 
295 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0130632  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0225  hypothetical protein  29.89 
 
 
260 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0822287  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2219  hypothetical protein  28.57 
 
 
717 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>