17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2219 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2219  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1390    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4973  hypothetical protein  40.18 
 
 
276 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0225  hypothetical protein  38.19 
 
 
260 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0822287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1387  hypothetical protein  33.85 
 
 
295 aa  101  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0130632  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1388  hypothetical protein  29.47 
 
 
253 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00793473  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  22.35 
 
 
1182 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  22.04 
 
 
609 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  25.19 
 
 
209 aa  47.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  31.68 
 
 
1115 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.98 
 
 
2277 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  20.09 
 
 
1239 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28018  predicted protein  17.51 
 
 
1372 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.56182  normal  0.422355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  30.32 
 
 
562 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  24.86 
 
 
10203 aa  45.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2063  hypothetical protein  24.18 
 
 
212 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3919  hypothetical protein  31.72 
 
 
335 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.58 
 
 
737 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>