16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02388 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1418    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  38.36 
 
 
703 aa  279  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  36.15 
 
 
667 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  35.67 
 
 
702 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  36.42 
 
 
719 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  34.42 
 
 
702 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  35.01 
 
 
713 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  33.77 
 
 
714 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  35.59 
 
 
561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  32.07 
 
 
562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  30.99 
 
 
549 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  38.86 
 
 
621 aa  110  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  44.58 
 
 
1898 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.59 
 
 
1147 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  40.62 
 
 
669 aa  91.3  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  36.79 
 
 
153 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>